2018年5月，南京航空航天大学秦淮创新研究院由学校与秦淮区人民政府共同发起，重点面向先进信息技术及智能系统、高端产业动力系统，以无人系统导航控制技术、新能源动力及车辆智能控制技术、航空设备等技术领域，开展技术研发、成果转化、企业孵化、人才培养等工作，服务学校建设和地方经济发展。
